Началом создания Института явилась, организованная в мае 1952 г. , Лаборатория электромоделирования при Нефтяной экспедиции АН АзССР. В 1956 г. В связи с реорганизацией Нефтяной экспедиции Лаборатория электромоделирования была включена в состав Института физики и математики АН, а с 1958 г. – переведена в состав Института математики и механики и переименована в Вычислительный центр (ВЦ).

В конце 50-х годов появление в Республике универсальных цифровых вычислительных машин положило начало исследованиям по численным методам и программированию. В 1960 г. ВЦ был выделен в самостоятельную организацию в системе АН Республики. В том же году в составе ВЦ была создана лаборатория ЭВМ (вторая после Украины среди бывших союзных республик), которая, в свою очередь, сыграла решающую роль в развитии кибернетики, информатики и других точных наук. В 1965 г. ВЦ был реорганизован в Институт Кибернетики (ИК).

На базе созданного в 1971 г. в составе Института «Отделa Автоматизированных Систем Управления», в 2002 г. был организован Институт Информационных Технологий. Институт Кибернетики был назначен Ведущей Организацией по созданию «Автоматизированных Систем Управления Республики» (1977-1981 гг.).

В январе 1978 года было организовано СКБ "Кибернетика” для создания и внедрения экспериментальных образцов разрабатываемых в институте приборов и устройств. Хозрасчетное бюро и сейчас функционирует с большим успехом.

В 2014-ом году решением Кабинета Министров название Института Кибернетики было изменено на "Институт Систем Управления".

Со времен создания до 1965-го года институтом руководил доктор технических наук, профессор Алескеров Саид Амираслан оглы, 1965-1970-х годах академик Гусейнов Ашраф Аскендер оглы, 1970-1988-х годах академик Аллахвердиев Джалал Эйваз оглы. С 1988-го года директором института является доктор технических наук, профессор, обладатель ордена «Славы», заслуженный деятель науки, академик Алиев Тельман Аббас оглы. С 22.01.2021 г. генеральным директором института является доктор технических наук, профессор, академик Аббасов Али Мамед оглы, а исполнительным директором - доктор технических наук, профессор, член-корреспондент НАНА Садыгов Аминага Бахман оглу.

Кадровый потенциал института:
В институте 3 академика, 5 член корреспондента, 32 доктора наук, 52 доктора философии.
В институте 7 отделов и 23 лабораторий.

Об институте на других сайтах:
Science.az | Wikipedia.org | Google Scholar | ResearchGate